（１）（３）解決しました。
（１）ドキュメントの新規作成、編集後に表示される「ドキュメントへのリンク：～」でのリンク先がおかしい
fdm.db.class.inc.php の makeUrl() 内 198行目を変更する
$path=getPath();
↓
$path=
$modx->config[’base_url’] . $this->getPath();
getPath(); は親のフォルダ名しか所得しないため base_url を補完する必要があります。
なんでだれも文句言わないんだろう？
※注意事項
このファイル(fdm.db.class.inc.php)を編集するには注意が必要です。
その原因を見つけるまでに半日かかりました。
stripAlias($alias) 関数内でアラビア文字（ギリシャ文字？）が使用されており utf-8 対応のエディタでも正常に
保存できない場合があるようです。
たぶん僕の使っていた「さくらエディタ」がutf-8 の日本語文字しか対応していないようなので保存後文字化けしていたようです。
対応策として、今回はサーバコントロールパネルのファイルマネージャーより変更を行いました。
ほんとうはこの部分を全角→半角などに置き換わるように日本語に対応させるべきだと思います。
（３）ドキュメントの新規作成、編集時のポップアップメッセージをなくしたい。
japanese-utf8.inc.php を変更
[+user.canadd:is=`1`:and:if=`[+link.disableadd+]`:is=`0`:then=`
<a href="[+link.add:esc+]"
onclick="return confirm(’ドキュメントを新規作成しても宜しいですか?’)" title="新規作成"><img src="[(base_url)]manager/media/style/MODx/images/icons/folder_page_add.gif" width="18" height="18" alt="新規作成" border="0" /></a>
`:strip+]
[+link.disableedit:is=`0`:then=`
[+user.ismoderator:is=`1`:or:if=`[+user.isauthor+]`:is=`1`:then=`
<a href="[+link.edit:esc+]"
onclick="return confirm(’このドキュメントの編集を行いますか?’)" title="編集"><img src="[(base_url)]manager/media/style/MODx/images/icons/logging.gif" width="16" height="16" alt="編集 " border="0" /></a>
`:strip+]
`+]
上記
赤字部分を削除するだけで目的が達成できました。まさか言語ファイルでメッセージを出しているとは・・
（２）ドキュメントの編集後「ドキュメントへのリンク：～」の下に編集前の内容が表示されており紛らわしい
上記の（１）（３）が解決したので書き込み後の動作をリダイレクトに変えてみたのですが思ったように動作してくれません。
次回「最終回」に続く・・・ :’(
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