Хм, MIGX галерея с AJAX загрузкой и fancybox (а зачем две галереи?),
Некоторые страницы это какие? Все, что в портфолио или другие?
Галереи пробовали отключать?
Логи модекса что говорят?
no-cache, apache... (show attach)
Ваше дело, но почему apache, а не nginx?
Ну и кеширование, куда же без него.
