
Больше одного INDEX ключа создано для колонки `id`. Может лишние/все индексы удалить нафиг (боюсь, мало ли ли зачем их использует МОДх).
ALTER TABLE <имя таблицы> AUTO_INCREMENT=0
возвращает ID, сгенерированный колонкой с AUTO_INCREMENT последним запросом INSERT к серверу, а если последний инсерт был с ID 666 и он запомнен, то... Может ли и где запоминает это МОДх?