Добрый день,
Посмотрел и поправил, проблема была в неверно указанном чанке для pdoMenu (см. аттач). Смотрим инструкцию по pdoTools:
Там, в частности, сказано, что
&tplStart Чанк оформления корневого пункта, при условии, что включен &displayStart
а он в свою очередь
Включает показ начальных узлов меню. Полезно при указании более одного «parents».
И поскольку у вас в коде было несколько родителей
этот чанк использовался для каждого из них.
Также была проблема с обновлением pdoTools, это показалось мне странным, я его снес и поставил заново.